Jessica Finck
Forschungsthema Amazon Tall Tower Observatory (ATTO)
Forschungsthema Molekulare Biogeochemie
Intern. Max Planck Research School for Global Biogeochemical Cycles (IMPRS-gBGC)
Aufgabengebiet
Ich habe mein PhD Projekt im Januar 2022 begonnen. Mein Ziel ist es unser Verständnis von Amazonas’ mikrobiellen Gemeinschaften und ihrer Aktivität zu steigern unter Zuhilfenahme von 16S/18S DNA Next-Generation Sequencing und Metagenomik. Dabei sollen vor allem saisonale und Ökosystem-bedingte Unterschiede der Gemeinschaftszusammensetzung und ihrer Funktionalität im Vordergrund stehen, sowie deren Link zu vorhandener gelöst organischer Materie (DOM) und biogener volatiler organischer Materie (BVOC).
Weitere Themen:
- DNA/RNA Extraktion & (quantitative) PCR
- Transformierung & Plasmid-Klonierung
- Analyse mikrobieller Gemeinschaften mittels QIIME2 & R
- α- und β-Diversitätsanalyse w/ vegan
- Differential abundance testing
- PICRUSt2, FAPROTAX, FUNGuild
- verschiedene Arten statistischer & Korrelationsanalyse (linear modeling, Spearman, uvm.)
Vita
seit 2022 Promotionsstudent am Max-Planck-Instutut für Biogeochemie, Jena, Deutschland
2020-2021 Wissenschaftliche Assistentin für Rebecca Cooper (Institut für Biodiversität, FSU Jena)
2016-2020 M.Sc. Evolution, Ecology and Systematics, FSU Jena
2018-2019 Akademischer Tutor für Stefan Halle (Institut für Ökologie und Evolution, FSU Jena)
2018 ERASMUS semester; Wissenschaftliche Praktikant im Projekt "Howling and Oxytocin
release in timber wolves (Canis lupus lycaon)" (Wolf Science Center, Österreich)
2015-2016 Akademischer Tutor für Johannes Wöstemeyer (Institut für Mikrobiologie, FSU Jena)
und für Maria Mittag (Institut für Ökologie und Evolution, FSU Jena)
2013-2016 B.Sc. Biologie, FSU Jena
Auszeichnungen & Zertifikate
2025 FEMS MICRO Conference Attendee Grant
2024 DAAD Research Stipend2022 Summer School on Multi'omics for Microbial Community Studies (Physalia Courses)
2021 Best Lightning Talk (Committee Award) (MiCom 2021)
2021 Summer School on Archaeogenetics and Paleoproteomics (MPI-SHH Jena)
2021 International Spring School on Hydrothermal Vents (EANA)
2021 Betrieblicher Ersthelfer im Feld nach §26 DGUV und §19 FeV
Publikationen
Cooper, R. E., Finck, J., Chan, C., Küsel, K. (2023). Mixotrophy broadens the ecological niche range of iron oxidizing Sideroxydans sp. CL21 isolated from an iron-rich peatland. FEMS Microbiology Ecology. DOI: 10.1093/femsec/fiac156.
Präsentationen
Finck, J., Lange, D. F., Quesada, B., Takeshi, B., Andreote, F. D., Gleixner, G. (2025, Jul 17). From the pan into the fire: How seasonal drought reduces microbial diversity and functional potential in the Amazon rainforest. [Conference talk] FEMS MICRO, Milano, Italy.
Finck, J., Lange, D. F., Quesada, B., Takeshi, B., Ferreira, S., Andreote, F. D.,
Küsel, K., Kothe, E., Gleixner, G. (2024, Apr 16). Seasonal drought
reduces microbial diversity and functional richness in the Amazon. [Conference talk] EGU General Assembly, Vienna, Austria.
Finck, J., Lange, D. F., Quesada, B., Takeshi, B., Ferreira, S., Andreote, F. D., Küsel, K., Kothe, E., Gleixner, G. (2023, Sep 25-27). Seasonal drought reduces microbial diversity in the Amazon. [Poster presentation] ATTO workshop, Manaus, Brazil.
Finck, J., Lange, D. F., Quesada, B., Takeshi, B., Ferreira, S., Andreote, F. D., Küsel, K., Kothe, E., Gleixner, G. (2022, Oct 3-7). The enigma of microbial community composition and functioning in different Amazon rainforest ecosystems. [Poster presentation] ATTO workshop, Manaus, Brazil.
Finck, J. (2021, August 27). Paleopathology of the Athenian plague 430–426 BC. Overcoming archaeological & epidemiological limitations through archaeogenetics? [Poster presentation] MPI-SHH Summer School, Jena, Germany.
Finck, J. (2021, March 29-31). From autotrophy to mixotrophy: Metabolic versatility of the Fe(II)-oxidizing Sideroxydans sp. CL21. [Conference talk] MiCom 2021, Jena, Germany.